您好！根据您的描述，存在一定的争议，首先从国税角度出发，企业办理进料加工做进料作价加工，经营单位开增值税发票给生产单位，生产单位开成品发票给经营单位，进行补税是没有问题的，但是从海关角度出发，海关对经营单位进口的免税料件进行监控，海关允许的加工贸易中的委托加工，经营单位委托生产单位加工，不能按照作价销售给生产单位，也就是不能按照作价销售，为了便于企业手册核销，不建议经营单位和生产单位按照进料作价加工处理。如有其它疑问，欢迎继续在电子口岸政务咨询平台上提问，谢谢！
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