您好！1.保税区内的公司是采用电子账册受海关监管的，享受国家保税的优惠政策。2.两者具有相同的法律效力，但使用的场景不同。备案清单用于采用备案制管理的情形，例如海关特殊监管区域企业向海关申报货物进出境、进出区，同一特殊区域内或者不同特殊区域之间流转货物等；报关单是用于报关制管理的情形，比如一般货物的进出口等。3.海关特殊监管区域（以下简称特殊区域）企业向海关申报货物进出境、进出区，以及在同一特殊区域内或者不同特殊区域之间流转货物的双方企业，应填制《中华人民共和国海关进（出）境货物备案清单》，特殊区域与境内（区外）之间进出的货物，区外企业应同时填制《中华人民共和国海关进（出）口货物报关单》，向特殊区域主管海关办理进出口报关手续。货物流转应按照“先报进，后报出”的原则，在同一特殊区域企业之间、不同特殊区域企业之间流转的，先办理进境备案手续，后办理出境备案手续，在特殊区域与区外之间流转的，由区内企业、区外企业分别办理备案和报关手续。《中华人民共和国海关进（出）境货物备案清单》原则上按《中华人民共和国海关进出口货物报关单填制规范》的要求填制。如有其它疑问，欢迎继续在浙江电子口岸咨询平台上提问，谢谢！
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