您好！根据您的描述，建议企业向税务部门申请把已抵扣了的进项税转出，企业拿税务部门的转出证明，再申请退还增值税。如有其它疑问，欢迎继续在电子口岸政务咨询平台上提问，谢谢！
http://www.cpa.js.cn/show/77166.html
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