您好！核销系统中的汇率是外汇局公布的汇率，即中国银行汇率，并不一定与所有银行一致，企业需要下载最新汇率，若已下载最新汇率，即以核销系统中的汇率为准。根据您的描述，由于汇率差导致核销差额多5560美元的，企业需至外汇局窗口办理差额核销手续并提交差额核销说明函（需经出口单位法人代表签字并加盖单位公章）、合同、核销单、报关单、收汇核销专用联及相应证明材料。如有其它疑问，欢迎继续在江苏会计网(www.cpa.js.cn)平台上提问，谢谢！
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