您好！因为企业签订合同中有延期收款的，企业在15个工作日内就需要办理延期收汇登记，选择预计出口日期，预计出口日期应晚于签约日期，所以企业在登记延期收款合同登记的时候，一般指合同签订有延期付款的条款后就可以进行合同登记了，而不是您说的货物出口后斤三个月了才去进行延期收款登记，您已经超过了延期收款登记的期限。您的情况需要和当地外管局说明情况，再办理登记。如有其它疑问，欢迎继续在电子口岸政务咨询平台上提问，谢谢！
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