您好！根据您的描述，贵司已超过了申报出口退税期限（90天）。目前已没有办法补救，只能作内销补税了。注：以后若遇到不能及时核销且出口退税期限将至的情况，建议企业申请延期退税。另可参考国税函[2010]89号：一、对出口企业受2008年以来国际金融危机影响，逾期取得出口收汇核销单的，税务机关可在对出口企业其他退税单证、信息审核无误后予以办理出口货物退（免）税。二、试行申报出口退税免予提供纸质出口收汇核销单的出口企业，因网上核销系统、信息传输等原因致使出口企业逾期收汇核销的，税务机关经审核无误后可按有关规定办理出口货物退（免）税。如有其它疑问欢迎继续在江苏会计网(www.cpa.js.cn)平台上提问，谢谢
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