您好！根据您的描述，如果您的商品只是简单的运到上海包装，然后再运回贵公司，由贵公司出口的话，就需要向海关申请跨关区外发加工，企业和上海的工厂签订委托加工合同，然后凭其所在地外经贸主管部门核发的批准证和贵公司所在的外经贸出具的生产能力证明，填制中国人民共和国异地加工贸易申请表，向经营单位海关提出异地加工贸易申请，经核准后，加工企业主管海关凭经营单位提交的加工贸易业务批准证、委托合同、生产能力证明、申请表及其他有关单证办理合同登记备案。如有其它疑问，欢迎继续在电子口岸政务咨询平台上提问，谢谢！
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